Το Αφεντάκειο σε συνεργασία με τον Δήμο Κιμώλου συμμετέχει στην εφαρμογή των υγειονομικών πρωτοκόλλων.
Διαθέτει την μία πτέρυγα του Οίκου Περιθάλψεως για την φιλοξενία όσων τυχόν χρειασθεί να τεθούν σε καραντίνα.
Το Δ.Σ. του Αφεντακείου Κληροδοτήματος Κιμώλου έκανε ομόφωνα δεκτό το αίτημα του Δημάρχου Κιμώλου(και μέλους του Δ.Σ.) κ. Κωνσταντίνου Βεντούρη να διατεθεί η μία πτέρυγα του Οίκου Περιθάλψεως, εφ’ όσον χρειαστεί, για την απομόνωση, τυχόν, υπόπτων κρουσμάτων του Κορονοιού, στο νησί.
Το Αφεντάκειο Κληροδότημα Κιμώλου έχει ήδη προμηθευτεί τα απαραίτητα είδη και εφαρμόζει, από την πρώτη στιγμή, τα απαραίτητα μέτρα απολύμανσης και προφύλαξης.
Η όλη εφαρμογή των πρωτοκόλλων Υγείας γίνεται με ευθύνη του Δήμου Κιμώλου, ο οποίος και θα διαχειριστεί, τυχόν, χρήση της πτέρυγας του Οίκου Περιθάλψεως.